近日，華大基因?qū)W院碩士研究生導(dǎo)師李貴波博士在乳腺癌研究方面取得多項(xiàng)進(jìn)展，相關(guān)研究成果在國(guó)際知名學(xué)術(shù)期刊發(fā)表。

李貴波課題組在Nature Communications發(fā)表了題為“Genomic alterations and evolution of cell clusters in metastatic invasive micropapillary carcinoma of the breast”的文章，該研究與天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院付麗教授課題組合作完成，李貴波為文章的共同通訊作者，這一研究成功地繪制出乳腺IMPC的基因組圖譜，揭示該基因組變異特征，發(fā)現(xiàn)IMPC的腫瘤轉(zhuǎn)移種子細(xì)胞并鑒定出其轉(zhuǎn)移相關(guān)基因，為IMPC患者精準(zhǔn)診治研究提供關(guān)鍵靶點(diǎn)。

項(xiàng)目納入17例IMPC腫瘤冰凍組織樣本及29例IMPC石蠟組織樣本，采用激光捕獲顯微切割技術(shù)（LCM）結(jié)合新型空間定位細(xì)胞團(tuán)測(cè)序（TCCS）技術(shù)獲取了442個(gè)腫瘤細(xì)胞團(tuán)，對(duì)IMPC腫瘤細(xì)胞團(tuán)的基因組學(xué)特征進(jìn)行了深入解讀。結(jié)果發(fā)現(xiàn)IMPC腫瘤細(xì)胞團(tuán)以單克隆轉(zhuǎn)移種子演化、侵襲和轉(zhuǎn)移：對(duì)IMPC原發(fā)灶及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶中的腫瘤單細(xì)胞團(tuán)進(jìn)行定位細(xì)胞團(tuán)測(cè)序，發(fā)現(xiàn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶中的腫瘤細(xì)胞團(tuán)起源于原發(fā)灶中的單克隆轉(zhuǎn)移種子。隨后在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶中繼續(xù)增殖和侵襲。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)這些具有高轉(zhuǎn)移潛能的亞克隆具有高頻基因組變異，并在臨床樣本中進(jìn)行了驗(yàn)證。研究結(jié)果明確，IMPC高淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率與基因組CNV的變異頻率成正相關(guān)。這些基因可用于預(yù)測(cè)預(yù)后，并為針對(duì)性的靶向治療提供了思路。

課題組還與深圳市人民醫(yī)院、西京醫(yī)院聯(lián)合在Clinical and Translational Medicine發(fā)表了題為“Neoadjuvant chemotherapy alters peripheral and tumor-infiltrating immune cells in breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing”的文章，李貴波為文章共同第一作者和通訊作者。

課題組對(duì)乳腺癌患者新輔助化療期間收集的腫瘤組織和外周血單核細(xì)胞（PBMC）共132，823個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。研究發(fā)現(xiàn)乳腺癌的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性，免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞的多樣性以及細(xì)胞間相互作用的復(fù)雜性，進(jìn)一步分析表明，乳腺癌患者新輔助化療會(huì)重塑血液循環(huán)系統(tǒng)和腫瘤局部的免疫微環(huán)境，通過(guò)IFNα和IFNγ信號(hào)通路下調(diào)使得治療后的腫瘤可能進(jìn)入免疫逃逸階段。在臨床中，這種現(xiàn)象可能提示對(duì)于在NAC后產(chǎn)生免疫抑制的病人，可考慮結(jié)合免疫治療以重新激活免疫反應(yīng)來(lái)獲得更好的療效，同時(shí)，評(píng)估患者血液中的干擾素水平也可能成為一種指導(dǎo)NAC后治療策略的依據(jù)。

全文鏈接：

Nature Communications：

https://www.nature.com/articles/s41467-021-27794-4

Clinical and Translational Medicine：

https://doi.org/10.1002/ctm2.621